La figura de INSTITUCIÓN AFILIADA fue creada en 1994 por la Facultad de Medicina, con el objeto de aportar a su política de participar activamente de la educación médica de postgrado mediante la interacción con las Instituciones médico-asistenciales que privilegian en su accionar la formación de recursos humanos. En este marco, se denomina Institución Afiliada a una Institución Asistencial y/o un Instituto de Investigación Básica o Aplicada en el cual se desarrollan actividades de postgrado, designadas como tales por la Facultad de Medicina por creerlo ella conveniente y basándose en la evaluación de que las mismas cumplen con el nivel y las exigencias académicas, científicas, asistenciales, de investigación y éticas que deben caracterizar a toda institución universitaria.

Las Instituciones Afiliadas a la Facultad de Medicina se comprometen, entre otras cosas, a participar en la Educación Medica de postgrado (desarrollo, elaboración y/o instrumentación de Carreras de Médicos Especialistas, Programas de Maestrías, Programas de Actualización y/o Programas de Educación Médica Continua) y a desarrollar programas de investigación conjuntos, facilitando el intercambio y complementación de recursos humanos y materiales.

En la actualidad, las Instituciones Afiliadas a la Facultad de Medicina son cuarenta y seis (46) y están ubicados principalmente en la Ciudad Autónoma de Buenos Aires y en el Gran Buenos Aires.